开发基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用项目的商业计划书

(框架书)

 

项目名片

 

目录

 

第一部分   项目背景

生物基因学检测应用项目的产业相关背景

中国政府的产业相关政策支持

有关基因组拷贝数目变异(CNV)的基本概念

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的优势

国际学术界解读基因组拷贝数目变异(CNV)临床意义的难点

国内基因组拷贝数目变异(CNV)临床应用的难点与不足

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测项目市场行业定位

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测项目市场现状

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的目标客户

基因组拷贝数目变异(CNV)相关法律与监管方面

项目组基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测的技术实力

 

第二部分   项目实施

项目目标

项目策略

核心团队

项目主要分析理论和技术清单

项目拟采用的主要技术与设备清单

拟开展的CNV和基因变异检测项目

实施计划

初期市场和营销

成本效益

盈利计划

融资需求

风险评估

 

第三部分   附件 

1.CNV的学术和技术相关领域报告

有关CNV的基本概念

CAV的临床意义和应用领域简介

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的进展

文献中关于基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的优势

2.市场和客户相关报告

国内主要基因公司及医学独立实验室企业简介

刚需产品调研及非刚需产品调研

国内主要基因公司及医学独立实验室企业的市场现状

3.拟开展的CNV和基因变异检测项目

4. 项目核心团队人员简历

5.深圳政府有关促进企业发展的政策支持

 

 

 
项目名片
企业定位: 民营高新生物基因技术和应用(医学类)
 
企业目标: 中国新型基因诊断标准化实用化(国际一流水准)
  新型基因检测和诊断实验室(国际一流水准)
核心团队: 美国基因检测和诊断技术专家
加拿大公共健康管理项目专家
中国高端人群医疗服务专家
中国财经和企业管理专家
 
核心技术: 基因诊断标准科学性量化实用化的知识体系(知识产权性质)
基因前沿检测和诊断技术
 
主要市场: 医学临床和非临床的生物基因诊断未来发展方向和趋势所在
 
产业规模: 每年上亿规模的新型生物基因检测和诊断服务业
 

项目优势:

本项目的优势是高端专业人才具有美国多年的基因组拷贝数变异(CNV)诊断研究经验及知识体系,通过实施本项目,建成一个国际一流水准的新型基因检测和诊断实验室,将前沿性和开创性地形成一个成熟可靠的自主原创性成果的产业体系。

本项目的最大的贡献将是把中国基因组拷贝数变异(CNV)临床应用层次提高到国际水准的行列,创建和提供一个基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测的国际一流服务水准平台,更好地满足人群基因诊断相关服务的需要。

 

本项目的前沿性和开拓性内容概要:

 

        第一部分   项目背景

生物基因学检测应用项目的产业相关背景
 

    基因检测(Genetic Test)是从染色体结构,DNA序列,DNA变异位点或基因表现程度,提供受检者与医疗研究人员评估一些与基因遗传有关的疾病、体质或个人特质的依据,也是精准医学分析的一种方法。每一个人的DNA基因都是独特的个人化资讯,造成每一个人的先天体质,健康状况,特征都不相同。

    一方面,尽管基因检测领域还处于新兴产业之中,但中国现有的基因诊断技术和相关临床应用已经成熟,竞争激烈。另一方面,中国新兴的基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用却相对落后,许多方面甚至没有开展或处于空白状况,面临急待提高局面。

    基因组学应用行业属于发展最快的高科技行业之一,以美国为代表的基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用已经开展,开辟了一个新兴的基因诊断服务市场。也正在完善和形成一个新的基因组拷贝数目变异(CNV)检测标准。

    2019年科技部部长万钢表示,与建设世界科技强国的伟大目标、国家经济社会发展的战略需求和当前生物技术迅猛发展的国际态势相比,中国生物技术发展还存在着自主原创性成果少,关键核心技术仍受制于人,技术转化效率低,产业化发展能力不足,生物战略资源保护和利用不够等问题。

    本项目的优势是专家型高端人才具有美国多年的基因组拷贝数变异(CNV)诊断研究经验及知识体系,开发项目的理论和技术起点就是直接从国际前沿水准起步,将在国内前沿性和开创性地形成成熟可靠的自主原创性成果的产业体系。本项目的最大的贡献将是把中国基因组拷贝数变异(CNV)临床应用层次提高到国际水准的行列,创建和提供一个基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测的国际水准服务平台,更好地满足人群基因诊断相关服务的需要。

 

 

( https://www.chenpe.com/news/110661.html )

 

 

中国政府的产业相关政策支持
 

    2015年,中国科技部成立了中国精准医疗战略专家组和国家精准医疗战略专家委员会,并计划2030年前在基础研究和应用研究方面投入600亿元,至此,精准医疗在中国已经上升为了国家战略

    2015年,国家卫计委发布《关于产前诊断机构开展高通量基因测序产前筛查与诊断临床应用试点工作的通知》,无创产前基因检测重新启动,试点产前诊断机构可择优与承担高通量基因测序检验试点任务的医疗机构建立合作关系。

    20175月,科技部制定了《十三五生物技术创新专项规划》。提到,发展新一代基因测序技术,重视单分子技术的应用和测序数据的分析解读;发展单细胞分离、基因组扩增、转录组扩增和单细胞基因组分析技术;发展基因和蛋白质精准测量技术,推动生物检测技术向微量、痕量、单分子、高通量等方向发展。

    2018年,科技部牵头,发改委、财政部共16部委组成的《国家生物技术发展战略纲要》编制;要凸显国家战略意志,中长期布局,超前部署谋划,引领跨越发展。同时,要技术创新与体制机制创新双轮驱动,开放融合发展。

    在国家的相关政策支持持续加码的利好行业长期发展情况下,中国生物技术发展步入战略机遇期,开发基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的项目正处于这么一个有利的时期。

 

 

有关基因组拷贝数目变异CNV的基本概念

 

    自从上世纪80年代基因检测遗传病研究开始以来,基因检测疾病取得了长足的发展,特别是人类基因组计划完成之后,基因组医学的迅猛发展,一批人类疾病相关的基因被揭示而后迅速用于了疾病的风险评估、预防、诊断和治疗,对人类的健康起到了不可替代的作用。近年来,随着深度测序技术的发展和应用,更多的遗传病和恶性肿瘤的基因诊断得到了迅速的推广和应用。

    基因组检测(genomic testing:遗传学中一个较新的领域,它指的是对一个生物体的全部基因组(构成生物体的基因)进行观察的过程。与基因检测(genetic testing)只对某个特异基因或特定的基因组进行观察有所不同,基因组检测对遗传密码里任何的基因改变或有害变化进行广泛的测试。

    拷贝数异常(copy number variations, CNV)是属于基因组结构变异(structural variation),通常使基因组中大片段的DNA形成非正常的拷贝数量。亚显微水平的基因组结构变异是指DNA片段长度在1Kb-3Mb 的基因组结构变异,包括缺失、插入、重复、重排、倒位、DNA拷贝数目变化等,这些统称为CNV(也称为拷贝数多态性(copy number polymorphisms, CNPs)。CNV最初是在病人的基因组中发现,但后来的研究表明在正常人体中也普遍存。目前,按照CNV是否致病可分为致病性CNV、非致病性CNV和不明临床意义CNV

    拷贝数变异(CNV)位点的突变率远高于一直以来研究较多的单核酸多态性SNP,是人类疾病的重要致病因素之一。 CNV变异同样涉及到所有临床学科,数百上千种疾病涉及CNV的异常,包括遗传病、心血管疾病、肿瘤、神经疾病、结缔组织疾病等等。

 

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的优势

 

    人类已知的染色体疾病有200多种。大多数染色体疾病由染色体数目异常引起,以唐氏综合征最为普遍。另有部分染色体疾病因缺失或重复一段染色体片段(拷贝数变异,copy number variationsCNV)而引起,统称为染色体微缺失/微重复综合征。

    染色体疾病临床表型多样,表现为多发性先天畸形、肢体残疾、发育迟缓、智力障碍、癫痫症、自闭症和学习障碍等。近期对人类配子和植入前胚胎的研究揭示,患者固有的染色体不稳定性是其染色体发生异常的主要原因。

    CNV的形成与众所周知的非同源末端连接,以及新近提出的DNA复制扰动和不连续DNA复制有关。多种机制共同作用,原发性CNV的形成速度远远超过其他类型的基因变异。同时一些发生率低、但影响显着的染色体变异持续通过家族遗传得以传播。因此对人类健康和疾病的影响更为显著。

    这些CNV变异同样涉及到所有临床学科,数百上千种疾病涉及CNV的异常,包括遗传病、心血管疾病、肿瘤、神经疾病、结缔组织疾病等等。CNV的检测可为这些疾病的从基因水平提供诊断依据和治疗方案的选择提供参考意见。

    CAV全基因组关联分析的出现,这一策略和传统的基于单核酸多态性的关联分析具有互补性,通过认识基因组结构变异可以认识复杂疾病的分子机制和遗传基础。

    DNA拷贝数变异(CNV)是一种介于1kb至20Mb的DNA片段的变异,在人类基因组中广泛分布,极大地丰富了基因组遗传变异的多样性。目前已经 发现大量的基因病是由基因组结构改变引起的,而非传统的 Watson-Crick 碱基配对变化所引起,其中一些基因病是由重组区域的基因拷贝数发生改变所致。研究发现,大部分CNV都与复杂疾病密切相关。2019410日,《低深度全基因组测序技术在产前诊断中的应用专家共识》(以下简称《共识》https://xueqiu.com/5137094471/125030468)在《中华医学遗传学》杂志上刊发。《共识》的发表对规范CNV技术的临床应用,推动技术发展起到了非常重要的作用。在《共识》的指导下,可以预见CNV技术将会在我国的产前诊断中心进一步普及应用,协助临床医生进行精准产前诊断,有效缓解产前诊断压力。以产前诊断为例,CNV技术具有通量高,成本低,实验操作简便,检测分辨率高,临床应用成熟稳定等特点,在一定程度上彻底改变了中国产前诊断供给不足的局面。使得中国产前诊断的核心痛点逐渐从"供给不足"转移到"遗传咨询能力不足"的问题上来了(http://www.seqchina.cn/10733.html) 国际肿瘤学杂志(2012年8月第39卷第8期)综述报导:CNV如果发生在肿瘤相关基因序列内部或周围可能引起癌基因激活、抑癌基因失活,最终导致肿瘤的发生。CNV通过改变基因剂量、调节基因活性影响基因表达、表型差异和表型适应,从而引起肿瘤以及其他遗传疾病。研究CNV对于探索染色体重组、基因组进化、基因表达以及多种复杂疾病尤其是肿瘤的发病机制有很大帮助。中华实用儿科临床杂志『2017,32(12)』报导:不明原因智力障碍64例全基因组拷贝数变异分析,64例智力障碍患儿中16例检出CNVs,检出率为25%16CNVs中,6例微缺失/微重复片段<5Mb,最小检出缺失片段0.53Mb,这在常规染色体核型分析中是无法检出的。

    目前国内基因组拷贝数目变异CNV临床应用的不足,是因为检测和诊断水准尚待提升,而开发基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的意义则是挖掘和发展其具有更新更广更精更深的诊断优势所长。随着中国相关诊断供给能力的提升,大规模相关诊断临床实践经验和中国CNV大数据的积累必定会大大推动中国相关临床学科诊断依据和治疗方案能力的提升。

 

 

国际学术界解读基因组拷贝数目变异CNV临床意义的难点

 

    随着CMACNV-seqWESWGS等高分辨率技术应用于人类基因组CNV检测,临床上检测出大量的CNV片段。对于如何解读检测出的CNV临床意义,长期困扰着临床医生和基因检测机构。基因变异的解读作为遗传咨询工作中重要组成部分,也是最具有挑战性的工作,在我们基因变异的解读仍然是面临的重大问题。

    为了促进CNV解读报告的一致性和科学性,已有中英文指南或文献可供参考,但相关指南重点在方向性的指导,可操作性弱,尤其是对于重复CNV的解读报告。2015年美国遗传病协会ACMG发表一个初步简单的CNV临床意义分析指南,基因CNV变异的解读基本都是基于这个指南,但它是很不完善一种框架化的指导,无法满足特定的临床环境,在评估指标、疾病关联等方面急需要细化和拓展。但由于CNV致病性的分析是非常复杂的过程,需要考虑许多证据、个性特征以及了解证据的复杂性,目前在制定完整而全面的评判标准非常困难,各基因诊断机构都缺乏正式和完整的判定标定。

    国际学术界而言,CNV解读流程都是参考CNV与人群多态性数据库、微缺失/微重复综合征数据库、基因组异构数据库、网络数据库、文献中报道以及是否包含重要功能性基因等来确定临床意义。

    虽然越来越多的组织及公司开始采用美国分子病理学会(AMP)和美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)提出的指南,但这些指南都是自愿依从的,而且这个领域也在不断发展中。此外,近期的研究表明,即使使用相同的解读框架,不同实验室的病理学家也存在分歧,甚至在某些情况下,对于同一个变异的致病性,不同机构会有着截然不同的结论。

    在2016年美国分子病理学会(AMP)年会上,研究人员曾分享了来自于AMP工作小组名为VITAL项目的早期研究数据,该计划旨在揭示不同实验室对于相同遗传变异的解读存在差异的确切原因。结果显示,即使AMP采用使变异解读更统一的策略或依据指南,差异也仍然存在。而差异存在的原因很大程度上就是统一的策略或依据指南的具体可操作性弱,急需要细化和拓展。

    当前,基因组变异CNV检测结果的分析的复杂性解读的责任问题是非常复杂的,因为在一个缺乏标准化的领域中,难免会遇到定义模糊的问题。本项目正是针对这种国际上还面临的困局开发一种前沿性的解决方案或建立一种新型标准。

 

国内基因组拷贝数目变异CNV临床应用的不足

 

    1.检测结果判读能力缺乏:对CNV判读能力的不足时困扰分析人员的最大问题,也是造成在国内CNV应用受到限制的主要原因,如果不能正确和全面的判读检测结果,将不能为临床提供有效和精确的诊断。对于罕见的新生突变,部分与突变基因的外显率相关,对这类致病性的CNV的判读和解释是最大的难点。

    2.应用领域的片面性:目前在国内只有极为少数具有技术条件和资质的医疗机构和公司进行CNV的研究和临床应用,主要应用在儿童复杂罕见遗传病、自然流产新生儿死亡等妊娠常务的遗传学检测、产前诊断核型异常的进一步异常分析,应用范围局限,积累的经验少。事实上,CNV的存在是人类的很多疾病的原因,包括多种肿瘤(结肠癌、肺癌、胰腺癌、内分泌肿瘤、颅内肿瘤等)、罕见疾病(PWAS综合征)、多种神经系统疾病、多种心血管疾病、多种代谢疾病,线粒体疾病的CNV检测在国内尚未开展,亟待开发临床多学科应用。

    3.检测结果的验证缺乏规范化。新技术的发展、成熟和应用,必然会对临床体系产生巨大影响。目前在国内临床CNV诊断的实践中,各级医务人员没有统一的认识来如何正确定位适宜的临床适应症,对CNV技术的临床使用中的技术路线、遗传咨询、应用规范、差异性结果的判定以及临床研究方向,都是亟待解决的重大课题。

    4.检出率的低下:不同的CNV检测平台和基因芯片的分辨率会造成同一样本得出不同的检测结果。目前的国内采用的方法主要是低分辨的基因芯片,因此造成很多有意义的病理性的CNV不能检测,例如贝瑞基因的检测精度在5KB大小的缺失和重复,事实上,在人类基因组重不仅存在大片段的CNV,同样也存在大量的小片段CNV涉及到单个基因和单个基因的外显子,这些也是造成疾病的重要原因。由于技术和仪器精度的不够使得这个片段被大量错失不能检出。另外也有大量的病理性CNV起始点和终止点存在于基因内含子,常规方法都不能够检测到,从而造成大量的漏诊和误诊。目前国内仅有极少数几家公司开展CNV相关的检测,但都存在低精度的问题,以国内在此领域最先开展工作的贝瑞公司为例,目前只能对90%CNV断点定位在5KB5000bp)范围内。

 

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测项目市场行业定位

 

    基因测序行业的上游为测序仪、测序试剂和耗材的供应商,代表公司为IlluminaThermoFisherRoche等;中游主要是测序服务机构以及生物信息分析机构,代表公司为华大基因、贝瑞基因、达安基因、迪安诊断、Illumina等;下游为测序服务的用户,主要是个人、医院、制药企业、政府研究机构、高校研究机构等。

    开发基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的项目属于基因测序行业的中游。拷贝数变异(CNV)在人类基因组中广泛分布,极大地丰富了基因组遗传变异的多样性。目前已经发现大量的基因病是由基因组结构改变引起的,而非传统的碱基配对变化所引起,其中一些基因病是由重组区域的基因拷贝数发生改变所致。研究发现,大部分拷贝数变异(CNV)都与复杂疾病密切相关。

    解读或分析基因数据的评判标准,以体现基因测序的意义,这才是一项最实际的应用,这属于基因测序行的中游服务链的最重要的一个环节,或关键点。本项目的目标之一就是打通这个环节,拓展新一代的人类疾病基因组诊断服务产业。

    随着中国相关诊断供给能力的提升,大规模相关诊断临床实践经验和中国CNV大数据的积累必定会大大推动中国相关临床学科诊断依据和治疗方案能力的提升。

 

 

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测项目市场现状

    当前人们对拷贝数变异与疾病关系的认识主要集中于发育疾病、感染与免疫疾病、神经系统疾病以及各类肿瘤。

    国内对拷贝数变异与疾病关系的认识主要集中于产前遗传疾病,发育疾病。目前,在全国十大基因公司中,开展CNV检测业务的有三家,即:贝瑞和康,安诺优达,华大基因,且以贝瑞和康的贝全安-WES+CNV-Seq服务套餐较为领先。三家公司的业务局限于产前诊断,。

    在相关检测技术快速发展的推动下,人们已经发现了诸多与各类疾病发生密切相关的拷贝数变异。美国等世界一流的机构已经开展研究探索CNV与感染、免疫疾病、心血管疾病、内分泌疾病、神经系统疾病以及各类肿瘤的关系,并开始逐步应用于临床诊断和家族高风险人群的评估。

    20183月份,美国基因检测公司23andMe获得了FDA(美国食品药品监督管理局)的批准,可以在没有医生处方的情况下,向消费者提供特定的癌症基因检测产品。这意味着美国基因检测行业监管进一步放宽。同一天,立足消费级基因检测的国内公司23魔方宣布完成新一轮融资,总额1亿元人民币。前瞻产业研究院预计,未来五年我国基因检测复合增速在35%左右,2020年有望突破300亿,更长远的潜在市场过千亿。

    本项目选择对CNV检测有成本效果的技术基础上,建立一个CNV诊断评估标准,开发一个精确的分析工具。加入定量生物学和统计学方法,使得能够优化信噪比,从而降低CNV诊断评估成本,能更广泛开拓市场。

 

 

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测的目标客户
 

客户包括:

    个人、医院、制药企业、政府研究机构、高校研究机构,也包括健康人群、高危人群,也可辅助治疗、预后监控。基因组拷贝数目变异(CNV)可应用于临床和非临床方面,临床上,基因测序可用在生育健康检测、病原体感染检测和肿瘤基因检测。非临床上,可用于基础医学研究、新药研发、农牧业育种、生物多样性保护、司法鉴定、环境污染治理等。

 

客户渠道:

    中大型医院临床检测:涉及临床学科的方方面面,绝大部分医院不能自行开展这些检测。

    健康管理和天赋基因的综合类检测:让消费者对自己的基因遗传情况以及患病可能有一定了解。

    直接面向顾客(direct to consumer, DTC)类检测:了解家族历史、遗传疾病潜在风险,更好地规划生活、规范行为。

 

 

基因组拷贝数目变异(CNV)相关法律与监管方面

 

    国家卫生计生委的职责是审查和规范基因检测机构的资质,国家食药监总局则对基因检测链上的仪器、试剂、分析软件进行监管。

    基因检测涉及的伦理、隐私、遗传信息保护和生物安全等问题尚未得到明确和统一的监管。

    如果从事疾病检测或者产前检测,卫计委、国家食药监总局等会要求一些许可和相应的证书。

    国内已经有基因组拷贝数目变异(CNV)产前诊断的临床检测的应用,说明监管方面“支持、鼓励前沿技术和产品在通过安全性、有效性评价的基础上尽早惠及公众”。

 

 

项目组基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测的技术实力

 

    目前美国三大临床检验公司(AmerCorp, Quest, Bioreference),目前,只有Bioreference旗下的geneDx2019年初开始尝试采用WGS进行CNV检测,但也属于初始阶段。开发本项目的优势是高端技术人才具有美国多年的基因组拷贝数变异(CNV)诊断研究经验及知识体系成果,已经在美国最大基因检测诊断公司之一开展了美国及全球临床检测诊断业务,形成了成熟可靠的可以直接引进产业体系。

    本项目组团队已经很好的掌握多种与基因突变分析相关的技术,并在过去的数十年的临床医学、遗传研究、基因诊断领域积累了丰富的经验,希望在未来通过我们的努力将这些分析方法应用到CNV的临床意义的评定方面,并制定了一整套属于本项目独特和独有的CNV致病性的量化指标与评判标准,这将对提高诊断评判的一致性,对临床致病性分析具有重大的意义,而且可为临床提供准确而又具有诊断和指导意义的检验结果报告。并期待利用本项目的技术实力所长,奠定在CNV检测和评判方面的行业技术优势,并协助带动和提高中国基因CNV诊断水平到一个新的高度。

    因此,我们基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测项目技术实力具体而言就是:

    1.基于采用与美国类似项目的同步使用技术和设备,保持国内类似项目的领先实验室水准进行CNV检测。

    2.有能力为CNV的临床意义制定一整套详细评判标准,包括单基因疾病和多基因疾病的致病意义的标准,有效弥补国内在这方面的不足,这对临床具有重大的意义。

    3.有能力制定一整套本项目独有的多基因和单基因的解读量化指标,具备全面的科学性、逻辑性、可操作性。

    4.有足够技术实力和基因诊断水准提供更全面而准确的基因诊断服务。

    本项目的技术实力所长,不仅具有行业技术优势,还能带动和提高中国基因诊断水平到一个新的高度。

 

 

 

         第二部分   项目实施

 

项目目标

 

    依托创新的检测技术、精准的检测方法和严谨的科学态度,实现:

    1.开发和建立一整套基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的新标准和诊断评判流程。

    2.开发和制定一整套本项目独有的多基因和单基因的解读量化指标,具备全面的科学性、逻辑性、可操作性。

    3.开展国内尚未开展的基因组拷贝数目变异(CNV)临床和非临床应用的新型业务。

    4.增加科研开发能力,建立具备国际一流水准的基因诊断实验室,带动和提高中国基因诊断水平到一个新的高度。

 

 

项目策略
 

    1.组建公司: 实验室独立经营模式即基因检测公司独立组建实验检测中心。

    项目初期建立主要采用基于采用与美国类似项目的同步使用技术和设备,保持国内类似项目的领先实验室水准进行CNV检测。项目选择对CNV检测有成本效果的技术基础上,建立一个CNV诊断评估标准,开发一个精确的分析工具。加入定量生物学和统计学方法,使得能够优化信噪比,从而降低CNV诊断评估成本。也使得CNV能更广泛开拓市场。利用与美国类似项目的的临床检测实验室和新型基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测标准及诊断的高端人才优势,对国内尚未开展或开发的基因组拷贝数目变异(CNV)临床和非临床应用开展新的业务服务。

    2.通过海外基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的高端专业人才的知识和技术,开发基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的新标准和诊断评判流程。开发多基因和单基因的解读量化指标新标准。并推进二套标准的知识产权体系化和向市场化的转变。

    3.在检测项目获得CFDA获得批准临床应用之前,与面向高端人群的医疗健康咨询体检机构和体检中心合作,加入CNV和相关的基因检测项目,实现实验中心建设完善期间,获得部分收入以补偿或支撑实验中心的日常运作。

    4.进一步发展国际上的最新WGS技术的临床检测实验室。新WGS技术实验室不仅仅符合中国标准(参照《临床分子病理诊断实验室二代基因检测专家共识》),还将具备国际一流水准。对国内尚未开展或开发的临床和非临床应用进行新的业务。

 

 

核心团队

 

  
照片

谭端军 

医学博士 项目创始人 

毕业于中南大学湘雅医学院医疗系和解放军总医院军医进修学院;从事临床医学、遗传学与肿瘤研究十多年;先后在美国乔治城大学、纽约医学中心、美国三大基因检验公司中的QUEST和BIOREFERENCE从事人类疾病基因学研究和诊断工作近二十年;在美国BIOREFERENCE公司担任基因组拷贝数目变异(CNV)项目首席科学家及该项目研究团队负责人五年;率先开展了该CNV项目的全球(主要是殴美发达国家)最具学术前沿的诊断业务,学术成果发表在美国遗传学杂志等国际学术期刊上,拥有非常丰富的人类疾病基因学的知识和经验。

 

 
   照片  

夏成  

公共健康硕士 项目创始人 

毕业于中南大学湘雅医学院医疗系和美国EMORY大学;先后从事国家卫生部、世界卫生组织(WHO)世界银行(WORLD BANK)美国疾病控制中心(CDC)大型健康项目研究和管理工作十多年;在国际大型金融集团的美国大都会保险公司(METLIFE)加拿大明信理财集团(CLARICA)和永明金融集团(SUN LIFE)工作二十年;拥有丰富的健康项目管理基金、保险、税务、投资等专业工作经验。主要获奖:联合国开发计划署项目管理研究成果奖;美国大都会保险公司成就奖。

 

 
照片

周建国  

高级经济师 项目合伙人

毕业于湖南财经学院;1993年开始从事投资银行工作;先后任职于北京京华信托、大鹏证券、国元证券、湘财证券、中山证券、五矿证券等单位;全国首届经济师获得者,通过首届证券投行从业资格考试;主持山东浪潮、山东电缆、鲁银投资、正虹科技、银山化工等公司IPO上市业务;对企业上市、并购重组、财务顾问等业务具有丰富的实际操作经验。

 

 

 

项目主要分析理论和技术清单

 

拷贝数目变异CNV位置与结构分析

基因组变异数据库正常人群发生频率比对分析

已知和相邻大片段微缺失微重复综合征数据库比对分析

已知和相邻小片段缺失与重复的疾病数据库比对分析

特定疾病的相关最小重复区域分析

区域内基因受累结构与蛋白功能判定分析

CNV导致的无效等位基因分析

基因截断与延伸分析与判定

开放阅读框架分析

染色体倍性分析

受累基因功能结构域分析

功能基因分析,包括单基因疾病,多基因疾病的致病性关联分析

CNV遗传方式分析

剂量不平衡分析

受累基因功能丧失与功能增强的分析

突变耐受性分析

串联重复结构分析

杂合性丢失与单亲缘二倍体检测分析

基因型与表达型的关联分析

综合文献分析

 

 

拟采用的主要技术与设备清单

 

æ¯?è¾?NextSeq 550Dxå??MiSeqDx

设备:NextSeq 550Dx仪器 已获得批准供体外诊断使用。可应用与诊断模式:NGS IVD应用。研究模式:外显子组测序,靶向基因测序(扩增子、基因panel),全转录组测序,细胞遗传学芯片。 双重测序模式可用于临床检测和各种临床研究应用

试剂:NextSeq 500/550 v2试剂盒

 

   主要检测设备:Illumina 新一代全基因组测序技术,完美呈现基因组视图。

    该技术采用克隆扩增和边合成边测序(SBS)的测序化学技术,实现了快速、准确的测序。该过程可在将DNA碱基整合到核酸链的同时对其进行识别。每个碱基在加入不断延伸的链时会发出独特的荧光信号,该信号可用于确定DNA序列的顺序。外显子组测序或靶向重测序等有侧重点的方法只分析基因组的有限部分,全基因组测序则不同,能提供整个基因组的全面视图。它是各种发现应用──如鉴定致病变异和新基因组组装──的理想选择。全基因组测序可检测单核_酸变异、插入/缺失、拷贝数改变和大的结构变异。随着技术创新,最新的基因组测序仪能够比以往更高效地开展全基因组测序。全基因组测序可谓是基因组最为全面的研究方案。基因组信息已能用于鉴定遗传疾病,查找驱使癌症发展的突变,追踪疾病的爆发。 

    迅速下降的测序成本以及处理大样本数据能力的提升都使得如今的测序者可将全基因组测序视为基因组研究的最强有力工具。

SureScan Dx å¾®é?µå??è?¯ç??æ?«æ??仪  

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辅助检测与结果验证设备: Agilent或者Affymnetrix全基因组比较芯片技术。

    AffymetrixAgilent aCGH/CNV芯片的探针覆盖所有基因组,在包括基因区域(内含子区、外显子区)、基因间区域以及对疾病研究极其重要的亚端粒区域(除重复序列外)的分布大致相同。因此,利用此平台进行CGH分析具有敏感度高、精确度高,分辨率高(平均分辨率1.4kb)的特点,同时还可检测福尔马林固定的石蜡样品,实验数据可信度高,仅需1.5□基因组DNA即可进行实验。

 

设备: SureScan Dx 微阵列芯片扫描仪 Agilent SureScan Dx 微阵列芯片扫描仪已通过 CE 认证,可在美国以外的许多国家/地区用于体外诊断 (IVD)SureScan Dx 微阵列芯片扫描仪在美国为 II 级,510(k) 豁免。该高灵敏度系统体积小巧,在提高灵敏度并保持最宽动态范围 (XDR) 的同时可为实验室节省更多空间。作为完整微阵列芯片解决方案的基础,SureScan Dx 微阵列芯片扫描仪系统可以灵活地分析许多基因组学和细胞遗传学微阵列芯片。该系统还具有内置的臭氧防护系统,可最大限度减少信号衰减,此外还具有连续芯片加载功能,可加快使用速度。

试剂:CGH+SNP 微阵列芯片

 

其他小型设备:PCR扩增仪器,Sanger测序仪,样本处理和DNA抽提自动化设备

 

拟开展的CNV和基因变异检测项目

 

    CANS变异涉及到几乎所有的临床学科,数百上千种疾病涉及CNV的异常,包括遗传病、心血管疾病、肿瘤、神经疾病、结缔组织疾病等等。CNV的检测可为这些疾病的从基因水平提供诊断依据和治疗方案的选择提供参考意见。

    本项目拟开展和逐步开展的CNV和基因变异检测主要内容或清单列在附件3(拟开展的CNV和基因变异检测项目)之中,这些内容是目前比较前沿的临床检测,可以成为本项目的特色基因检验服务套餐或其它方式而开拓新的市场。

 

 

 

实施计划

 

第一年

    1.组建公司

    公司组织机构包括三个部分,即:决策机构(董事会)、执行机构(总经理及部门经理)和监督机构(项目投资方及相关监管方)。

    2.建立与美国类似项目的同步使用技术和设备的国际一流水准临床检测实验室及诊断评判新标准。

        仪器设备和试剂: 美国公司产品为主。并根据需要配置其它相关实验,办公,等仪器和设施。

    3.增添能开展其它基因检测业务的设备及人员;布局全面的基因检测市场。

 

第二年

    1.开展国内尚未开展的基因组拷贝数目变异(CNV)临床和非临床应用的新型业务。

    2.在第二年底前,培训致少二位具有高端水准的出具检测诊断报告人员,实验技术操作人员46人。

    3.在第二年底前,增添设备,扩大服务规模;开发全面的基因检测市场。开拓各种可行的市场营销模式。

 

建成实验室标准
检测和诊断水准: 达到基因组拷贝数目变异(CNV)的国际前沿
国内开创性的领先水准
 
诊断评估报告:  达到平均每天发送60份(CNV)的潜在能力
(大约年总量为20000万份的的潜在能力)

 

第三年及其以后

    1.监管项目开展,建立和扩大业务市场,增加赢利。

    2.进一步发展国际上的最新WGS技术的临床检测实验室。

    3.项目执行顺利的情况下,考虑项目更长远的规划,包括科研开发和企业上市等等事项的布局。

 

 

初期市场和营销

 

客户名单

    临床性质的检测诊断:个人、医院、制药企业、政府研究机构、高校研究机构。

    筛查或直接面向顾客:包括健康人群、高危人群。

 

市场营销模式

    传统广告,文宣,社会公益活动等多种形式提升企业知名度和企业形像。

    在实验室独立经营模式基础上,通过与医疗机构合作经营模式,与医疗机构外包合作模式,以及共建联合实验室等多种方式进行市场开发。

    在越来越多的各种委托第三方医学检验机构的招标项目中,积极参与各种委托第三方医学检验机构的投标项目。

    直接面向顾客(DTC)模式,指在没有医疗人员参与的情况下,直接向消费者销售的体外诊断产品模式。消费级DTC基因检测产品的消费全流程一般包括五步:购买检测、绑定账号、唾液采样、回寄试管、查看报告。

 

主要业务方面

    利用本项目的特点,进行有针对性的市场推广,力求把下面几个方面的检测、解读做精、做细,从而形成差异化竞争:

单基因疾病和多基因疾病的基因检测

肿瘤风险的筛查

生育健康

遗传病诊断

复杂疾病诊断

心血管遗传病诊断

代谢疾病

神经系统疾病

线粒体疾病

 

其它潜在市场

    例如,寻找参与遗传性肿瘤综合干预业务的市场与机会

 

成本效益

 

    本项目符合中国精准医疗服务、《“十三五”生物技术创新专项规划》和《国家生物技术发展战略纲要》编制的政策提倡,是国家在这些整体战略目标和政策的社会效益方面的一个具体落实和体现之处。

    基因检测属于高投入高利润的检测项目,也是未来明确疾病诊断的黄金标准。如果能够获得审批,开展临床服务,会带来巨大的经济和社会效益。

    美国三大临床检验公司(AmerCorp, Quest, Bioreference)之一的Bioreference旗下的geneDx2019年初开始尝试采用WGS进行CNV检测,代表着一个新兴的生物学应用行业的兴起。

    本项目将基于保持和国际前沿水准相近的目标,以小而精的设备和人员规模来控制成本的策略,实施边建设实验室边开展可能有的业务方式,实现建成一个具有国际前沿水准的新一代基因组检测诊断实验室。以本项目总投资2500万人民币的成本为考量,其直接效益--建成最新WGS技术的国际一流水准临床检测实验室(符合国家标准)--将是一个千万级以上的开展服务和业务的实体平台;按本项目将带动国内一个新兴的生物学应用行业预测,必将是上亿规模的产业。

    在中国率先建立的具有知识产权性质的相应诊断评判新标准所带来的经济和社会效益,则是难以估量的,将把中国的基因组拷贝数变异(CNV)诊断水准提升到国际水准上,也或成为具有国际学术前沿水准的一个中国品牌,将更多更好地服务于人群健康的需要。

 

 

盈利计划

 

保守估计:

    项目建设周期预期为二年,第三年预期盈利,第四年预期回收投资总额,第五年预期纯盈利达2000万水平的规模或更多。

 

    以保守平均每天20个检测样本,每个样本10000元人民币预计,一年的产业规模就可达到7000万以上,其中,纯利润以30%计,可达2100万。保守的每天20例样本预估是基于下列二种方式的市场必需可能性评估:

 

    1.检测样本中,如果按病症来源可以估计如下:

    肿瘤早筛:10-15例/每天(全年3650-5475例)

    生育健康:6-8例/每天(全年2190-2920例)

    少见病症:2-3例/每天(全年730--1095例)

    复杂病症:2-4例/每天(全年730--1460例)

    2.检测样本中,如果按送检来源可以估计如下:

    来自全国医疗机构(约2万家):10-20例/每天(全年3650-7300例)

    直接面向顾客方式(大众人群):10-20例/每天(全年3650-7300例)

 

具体计划:

    第一年:组建公司并建立国际一流水准临床检测实验室及诊断评判新标准。

    第二年:开展国内尚未开展的基因组拷贝数目变异(CNV)临床和非临床应用的新型业务。

    第三年:建立和扩大业务市场,纯盈利预期不低于1000 万元人民币。(以保守的平均每天10例样本的检测诊断,每例样本1万人民币计,利润为30%计。)

    第四年:扩大市场,纯盈利预期不低于1500 万人民币。 (以保守的平均每天15例样本的检测诊断,每例样本1万人民币计,利润为30%计。)

    第五年:扩大市场,纯盈利预期不低于2000 万人民币。(以保守的平均每天20例样本的检测诊断,每例样本1万人民币计,利润为30%计。)

    其后:考虑项目更长远的规划,包括科研开发、更多服务项目开发和企业上市等等事项的布局。

 

实际可能:

    随着中国中产阶层和富裕人群数量的增长,人们对自身健康和健康生活质量的重视程度也将相应更多的关注,而更新更广更精确的疾病(包括肿瘤)筛查的诊断技术和能力也将在这些方面显示其市场需要性,而本项目的新型基因检测和诊断方法则是满足这种市场需要的时机点,相应的市场需求会越来越大。

    一方面,基于精准医疗和现代健康管理模式,具体市场开发计划将会是多种形式;另一方面,基于人工智能和大数据时代,将导致或带来新的市场机遇。

    开阔国际视野和市场,提前布局,多方多平台合作共赢市场模式也将是未来趋势。

    基因组拷贝数变异(CNV)诊断水准提升到国际水准上是医学临床和非临床的生物基因诊断未来发展方向和趋势所在,很大程度可以更充分开发其应用市场,并达到可观的盈利(实际达到产业规模上亿的可能性很大)

 

参考:

国内四大医学独立实验室2018年营业情况:

( https://wemp.app/posts/d577ca97-99d4-4dad-8ec4-70d967f93963?utm_source=bottom-latest-posts )

 

 

融资需求

 

第一期(第一年) 融资需求 1500 万元人民币,主要用于:

    1.组建公司、办公场地及设施: 100 万。  

    2.建立与美国类似项目同步使用技术和设备的临床检测实验室:1000 万。  

    3.人员:260 万。

    第一年公司员工预设为8人,其中: 技术高管(1人);项目高管(1人);财经高管(1人);专业医生(1人);技术人员(2人);办公人员(2人)。

    4.其它:140 万。

第二期(第二年) 融资需求 1000 万元人民币,主要用于:

    1.市场开发: 300 万。 

    2.办公场地及实验室维持业务运转的费用: 300 万。

    3.人员:330 万。

    第二年公司员工预设为12人,其中:技术高管(1人);项目高管(1人);财经高管(1人);专业医生(2人);技术人员(4人);办公人员(3人)。 

    4.其它:70 万。 

(注:因为市场的开发及增添能开展其它基因检测业务的设备及人员。项目也有可能开始部分创收。)

 

第三年及其以后: 实现盈利预期

 

 

风险评估

 

    投资风险主要体现在下面几个环节:

    1.资金是否能及时到位。

    2.相关资质的申请和获得政府批准:包括营业执照,检验许可证,检测中心实验室建设需符合国家标准。

    3.检验许可所需的前期临床试验报告,需要获得CFDA审批。

    4.前期试验和CFDA审批过程时间长,需要一年甚至更长时间。

 

    总体而言,只要建成最新WGS技术的国际一流水准临床检测实验室并可以开展业务,就达到了预期的初步目的,这种服务实体的形成,具有市场竞争优势,可以进一步融资和/或开展其它合作机会。

    从成本效益的角度,WGS技术的国际一流水准临床检测实验室的建成也就足够可以补偿前期的资金总投入。

 

 

 

 

第三部分 附件       

 

1.CNV的学术和技术相关领域报告

有关CNV的基本概念

CAV的临床意义和应用领域简介

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的进展

文献中关于基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的优势

 

2.市场和客户相关报告

国内主要基因公司及医学独立实验室企业简介

刚需产品调研及非刚需产品调研

国内主要基因公司及医学独立实验室企业的市场现状

 

3.拟开展的CNV和基因变异检测项目

 

4. 项目核心团队人员简历

 

5.深圳政府有关促进企业发展的政策支持

 

 

1.CNV的学术和技术相关领域报告

有关CNV的基本概念

 

拷贝数异常(copy number variations, CNV) 是属于基因组结构变异(structural variation), 根据大小可分为两个层次:显微水平(microscopic)和亚显微水平(submicroscopic)。显微水平的基因组结构变异主要是指显微镜下可见的染色体畸变,包括整倍体或非整倍体、缺失、插入、倒位、易位、脆性位点等结构变异。亚微水平的基因组结构变异是指 DNA片段长度在 1Kb-3Mb 的基因组结构变异, 包括缺失、插入、重复、重排、倒位、DNA拷贝数目变化等,这些统称为CNV(也称为拷贝数多态性(copy number polymorphisms, CNPs)。

基因组拷贝数变异(CNV)是基因组变异的一种形式,通常使基因组中大片段的DNA形成非正常的拷贝数量。例如人类正常染色体拷贝数是2,有些染色体区域拷贝数变成1或3,这样,该区域发生拷贝数缺失或增加,位于该区域内的基因表达量也会受到影响。

如果把一条染色体分成A-B-C-D四个区域,则A-B-C-C-D/A-C-B-C-D/A-C-C-B-C-D/A-B-D分别发生了C区域的扩增及缺失,扩增的位置可以是连续扩增如A-B-C-C-D也可以是在其他位置的扩增,如A-C-B-C-D。CNV最初是在病人的基因组中发现, 但后来的研究表明在正常人体中也普遍存, 说明CNV是一组具有良性、致病性或未知临床意义的基因组结构改变。有统计显示, 目前共发现CNV约57,829个(这个数据不准确,肯定在更新):

 

 

1, 已发现的CNV与染色体位置关系,http://projects.tcag.ca/variation/),其中染色体倒位847;100bp~1Kb的插入缺失为30,748;倒置断裂位点约14,478个。

 

 

2, 目前一发现大量的CNV至少占到基因组的12%, 已成为基因组多态性和致病突变的又一重要来源。红色代表基因组大片段的缺失,蓝色代表基因组的片段重复。

 

CAV的临床意义和应用领域简介

 

人类已知的染色体疾病有200多种。大多数染色体疾病由染色体数目异常引起,以唐氏综合征最为普遍。另有部分染色体疾病因缺失或重复一段染色体片段(拷贝数变异,copy number variationsCNV)而引起,统称为染色体微缺失/微重复综合征。拷贝数变异(CNV)既有个体的正常多态性变异,也有致病性的变异。目前,按照CNV是否致病可分为致病性CNV、非致病性CNV和不明临床意义CNV 拷贝数变异(CNV)位点的突变率远高于一直以来研究较多的单核酸多态性SNP (Single nucleotide polymorphism),是人类疾病的重要致病因素之一。CNV基因的影比起SNP更大,一旦生往往会给生命体带来重大影,比如致出生缺陷、癌症等。

染色体疾病临床表型多样,表现为多发性先天畸形、肢体残疾、发育迟缓、智力障碍、癫痫症、自闭症和学习障碍等。近期对人类配子和植入前胚胎的研究揭示,患者固有的染色体不稳定性是其染色体发生异常的主要原因。稀有且相同的一些结构变异往往和疾病(包括癌症)的生相互关联甚至是其直接的致病因。比如,《我不是神》影中提到的慢粒白血病,就和基因结构变异直接相是由于胞中的9染色体22染色体臂相互易位,ABL基因和BCR基因融合,形成了一个会导ABL常表的小型染色体(称为费城染色体)生的。是一典型的结构变异致癌的例子。

CNV的形成与众所周知的非同源末端连接,以及新近提出的DNA复制扰动和不连续 DNA复制有关。多种机制共同作用,原发性CNV的形成速度远远超过其他类型的基因变异。同时一些发生率低、但影响显著的染色体变异持续通过家族遗传得以传播。因此对人类健康和疾病的影响更为显著。这些CNV变异同样涉及到所有临床学科,数百上千种疾病涉及CNV的异常,包括遗传病、心血管疾病、肿瘤、神经疾病、结缔组织疾病等等。CNV的检测可为这些疾病的从基因水平提供明确的诊断依据和为治疗方案的选择提供参考意见。 

 

 通过对比较单核苷酸多态性情况,可以了解拷贝数变异提供诊断依据和治疗方案意义

 

单核苷酸多态性

单核酸多态性SNP (Single nucleotide polymorphism)主要是指在基因组水平上由单个核_酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。

SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。但通常所说的SNP并不包括后两种情况。

在遗传学分析中, SNP 作为一类遗传标记得以广泛应用, SNP标记在人群中只有两种等位型(allele) 。这样在检测时无须像检测限制性片段长度多态性,微卫星那样对片段的长度作出测量,这使得基于SNP的检测分析方法易实现自动化。

 

基于SNP的检测分析方法易实现自动化。市场成熟。

 

仅检测染色体疾病。

 

国内基因公司已经全面开展。

 

 

 

拷贝数变异

人类已知的染色体疾病有200多种。大多数染色体疾病由染色体数目异常引起,以唐氏综合征最为普遍。另有部分染色体疾病因缺失或重复一段染色体片段(拷贝数变异,copy number variationsCNV)而引起,统称为染色体微缺失/微重复综合征。

拷贝数变异(CNV)既有个体的正常多态性变异,也有致病性的变异。目前,按照CNV是否致病可分为致病性CNV、非致病性CNV和不明临床意义CNV   

拷贝数变异(CNV)位点的突变率远高于一直以来研究较多的单核酸多态性SNP ,是人类疾病的重要致病因素之一。 CNV变异同样涉及到所有临床学科,数百上千种疾病涉及CNV的异常,包括遗传病、心血管疾病、肿瘤、神经疾病、结缔组织疾病等等。

CNV的检测可为这些疾病的从基因水平提供诊断依据和治疗方案的选择提供参考意见。

 

对于如何解读检测出的CNV临床意义,长期困扰着临床医生。市场待进一步开发。

 

能做到比传统意义上的无创产前检测检测更多的基因疾病而非仅染色体疾病。

 

国内仅少数基因公司有局限性开始开展。

 

 

 

图解基因组拷贝数目变异(CNV)的医学意义:

 

 

基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的进展

 

CNV检测方法

 

非全基因组的检测方法

1)    MLPA:多重连接探针扩增技术 (MCRHolland).

2)    FISH: 荧光原位杂交

3)    Sanger:  小片段测序

全基因组或接近全基因组检测方法

     1) Array:微阵列比较基因组杂交(ArrayCGH, Agilent

     2) WES:基于NGS下一代基因测序技术外显子组染色体异常检测

     3) WGS:第二代全基因组测序。染色体异常检测为最新的CNV检测技术 (对样本要求较低,能发现更多的新变异CNV, 代表着未来的发展趋势。

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1 CNV检测的主要方法和优缺点 :

 

 

WGS检测的主要优势

1.     覆盖度:指基因组被测序得到的碱基覆盖的比例。WGS覆盖更多的基因,目前全外显子测序WES覆盖的基因为21000个左右,而WGS则覆盖目前已知的人类所有基因约25000个左右;WGS对具体每个基因的覆盖度更好,由于基因序列的特殊结构(如高GC含量或串联重复区)外显子测序在该区域探针设计存在困难,而WGS不存在这样的问题;

2.     测序深度:是指测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。WGS不仅可检测所有的外显智,而且可以检测内含子区,虽说人类疾病有90%在外显子区,那也有10%是在内含子区,主要的致病基因可能是影响了转录本的剪切。由于绝大多数的CNV的断点位置并不位于外显子,而是存在于内含子,因此,只有WGS和基因芯片技术能够检测到这些CNV。

3.     线粒体基因组:WGS测序深度有2000-8000X,而外显子测序捕获区域一般不包括线粒体基因组,即使在IGV查看外显子bam文件,也会发现在线粒体中也会有一些少量的reads,但这些都不是特异的,不可信,需要联合一代测序检测线粒体基因组。

4.     WGS可以检测大片段的插入缺少(CNV)而且结果非常准确,而外显子测序基本不可以检测CNV,即使通过软件(如CODEX,XHMM)计算CNV也存在假阳性及假阴性太高的问题;而目前科研及临床都是用基因芯片来检测CNV,但是WGS检测CNV的分辨率在碱基水平,而密度最高芯片分辨率也在10K以上,即使一些特殊设计在外显子上的芯片,由于芯片本身探针效应等问题也很难达到宣称的外显子分辨率;

5.     WGS还可以检测平衡移位,如倒位与易位; 检测精度理论上可以实现检测到100 bp甚至更小的CNV,精确的确定断点位置, WGS可以检测新的,尚未报道的未知的基因突变和CNV

 

正因为以上几点优势,WGS在临床致病基因检出率更高,如严重智力障碍WGS检出率为60%左右,而全外显子为30%左右,自闭症WGS检出率为43%左右,全外显子为15-20%左右;简单来说WGS检测变异的能力大于全外+芯片+线粒体测序

 

 

Ilumina

Ilumina

 

 

 

 

 

Affymatrics Agilent基因芯片技术

 

 

 

 

 

 

文献中关于基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用的优势

 

有别于国内已经开展的基因测序技术和诊断,基因组拷贝数目变异(CNV)属于全基因分析和诊断的应用。CNV全基因组关联分析的出现,这一策略和传统的基于单核苷酸多态性的关联分析具有互补性,通过认识基因组结构变异可以认识复杂疾病的分子机制和遗传基础。CNV变异涉及到所有临床学科,数百上千种疾病涉及CNV的异常,包括遗传病、心血管疾病、肿瘤、神经疾病、结缔组织疾病等等。CNV的检测可为这些疾病的从基因水平提供诊断依据和治疗方案的选择提供参考意见。其临床检测应用的优势(如前所述)明显,但国内目前除贝瑞基因公司可能采用WGS外(尚不清楚),其它公司尚无WGS全基因组测序分析CNV,多数采用其他方法,这些方法都有多种局限性(详见表1),尚未开展临床服务。

 

在国内CNV应用于临床检测的方面,发现最新(2019/05/08)的一篇报导来自中信湘雅生殖与遗传专科医院的网站:

http://www.zxxyyy.cn/genetic/list/41.html

 

  由此可知,国内还只有个案的CNV应用于临床检测,尚未开发这一领域的临床检测应用。

   

 

2.市场和客户相关报告

 

    2000年人类基因体计画完成以来,越来越多的基因功能被解读成功,已超过2000种基因相关疾病被发现,如今已有700多种基因相关疾病已开发出相应药物及治疗方法。含癌症与许多罕见疾病,其药物的开发与应用都正在进行。目前基因检测的技术已渐成熟,所检测出的基因型除了应用在诊断与治疗之外,甚至能依据资料库的内容经数位化统计方式,预测尚未发生疾病的风险。

    20183月份,美国基因检测公司23andMe获得了FDA(美国食品药品监督管理局)的批准,可以在没有医生处方的情况下,向消费者提供特定的癌症基因检测产品。这意味着美国基因检测行业监管进一步放宽。同一天,立足消费级基因检测的国内公司23魔方宣布完成新一轮融资,总额1亿元人民币。前瞻产业研究院预计,未来五年我国基因检测复合增速在35%左右,2020年有望突破300亿,更长远的潜在市场过千亿。  

现今基因检测主要的应用方向包含:

身分鉴识/亲子关系鉴定/追溯祖源

单基因/染色体遗传疾病诊断与带因筛检

临床预防医学:多基因遗传疾病基因检测

临床个体化医疗:药物基因体学

先天体质/特质潜能分析  

 

基因检测相关企业主要有四类,一是采用“第三方医检所+医院+保险公司”的推广模式,针对临床基因、分子检测等项目,解决医疗机构医疗资源不足的问题,为民生相关的医疗服务奠定基础。二是通过引进及自主研发先进分子检测技术,提供分子诊断、基因检测、遗传性疾病及肿瘤早期筛查等服务,把基因检测的高端市场平民大众化,帮助受检者早诊早治。三是充分利用生物医药产业公共服务平台的优势,为高校、科研院所及企业提供技术咨询和检测服务。四是在司法鉴定服务方面,以提供DNA亲权鉴定业务为主。

目前,基因检测可分为四大检测板块:肿瘤易感基因、慢性病遗传病基因、产前与母婴诊断,以及各类包括健康管理和天赋基因的综合类检测。主要应用于医疗领域,且主要集中在生殖健康和肿瘤诊断及治疗两个领域。无创产前筛查是中国首个获批应用于临床的二代测序产品,也是基因行业是最成熟的一环;而肿瘤诊断及治疗被认为是下一个蓝海,企业争相布局。  

以一个比较成熟的市场产业链为例,《中国基因测序行业市场前瞻与投资战略规划报告》(数据来源参考)表明:随着二孩政策放开,高龄高危孕产妇比例明显增高,加上无创产前基因检测应用范围和检测范围的扩大,无创产前基因检测市场就有望在未来几年达到百亿元以上。

国内基因行业的龙头企业,布局了基因测序全产业链,包括上游的测序仪及试剂、中下游的基因测序服务提供,并在无创产检、PGS/PGD、肿瘤诊断及治疗、伴随诊断等方面有优势。  

 

基因组拷贝数目变异(CNV)目标客户包括个人、医院、制药企业、政府研究机构、高校研究机构,也包括健康人群、高危人群,也可辅助治疗、预后监控。基因组拷贝数目变异(CNV)可应用于临床和非临床方面,临床上,基因测序可用在生育健康检测、病原体感染检测和肿瘤基因检测。非临床上,可用于基础医学研究、新药研发、农牧业育种、生物多样性保护、司法鉴定、环境污染治理等。

2018年末,医院按等级分:三级医院1192个(其中:三甲医院722个),二级医院6780个,一级医院4989个,未评定等级医院6751个。目前全国几乎所有中大型医院都有对CNV检测的需求,这涉及所有的临床学科,绝大部分医院不能自行开展这些检测,必须委托第三方诊断公司。从有关报导来看,开展CNV的检测项目的,目前为止基本由贝瑞公司在做,但规模并不大。 健康管理和天赋基因的综合类检测,其针对目标为健康或亚健康人群,以较低廉的价格让消费者对自己的基因遗传情况以及患病可能有一定了解,这是市面上大众接触最多的一种类型。但这一类娱乐化较重,其专业性和医疗价值比较难以衡量,在专业性提升后潜力巨大。了解家族历史、遗传疾病潜在风险,更好地规划生活、规范行为,这一需求促使着直接面向顾客(direct to consumer, DTC)类测序服务飞速发展,数以百万计的消费者成为生物技术公司的客户群,这背后的巨大市场也引入了企业和资本的涌入。

2019年05月30日,世纪经济报道,直接面向顾客(DTC)是我国的主流模式,指在没有医疗人员参与的情况下,直接向消费者销售的体外诊断产品模式。消费级DTC基因检测产品的消费全流程一般包括五步:购买检测、绑定账号、唾液采样、回寄试管、查看报告。2016年参与消费级基因检测并拥有自身数据的个人用户总量约为10万人,2017年约为30万人。目前,中国消费级基因检测服务的人口渗透率是0.03%,也就是说在2022年,中国将有5000万人拥有自己的基因组数据,市场空间巨大。

          因此,开发基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用具有互补性的项目,不仅可以填补国内的市场需求,而且,也是未来基因诊断行业的发展方向所在。

 

 

国内主要基因公司及医学独立实验室企业简介

          目前,在全国十大基因公司中,开展CNV检测业务的有三家,即:贝瑞和康,安诺优达,华大基因。三家公司的业务局限于产前诊断。

贝瑞和康

(贝全安-WES+CNV-Seq服务套餐)

针对如智力障碍、发育迟缓儿童及因胎儿结构异常引发的流产物,建议进行全外显子组测序(WES)及低深度全基因组测序检测CNV-seq,同时检测单碱基变异及染色体畸变,提高临床诊断率。

哪些人可以选择贝全安-WES+CNV-Seq

1. 染色体核型分析正常,但临床表现为发育迟缓、智力低下、各种畸形、生育障碍等的患儿及其父母;

2. 发生反复流产,需要查明原因的家庭;

3. 超声显示胎儿结构异常、停育等流产。

 

安诺优达

(低覆盖度CNV检测)

安诺低覆盖度CNV检测的分析条目:

1. 染色体倍性变异和CNV检测;

2. 染色体倍性变异和CNV全染色体模拟图;

3. 染色体倍性变异和CNV注释。

可检测变异种类:

1. 拷贝数变异(分辨率~100 kb);

2. 非整倍体异常;

3. 多倍体异常(69, XXY);

4. 嵌合体。

 

华大基因:

1.华大基因康孕-染色体检测-100K (CNV-seq),通过对受检样本提取DNA,如胚胎绒毛组织、胎儿组织、外周血等,采用高通量测序技术检测23对染色体非整倍体变异、100Kb以上的缺失、重复,可用于排查自然流产、先天畸形、智力障碍、发育迟缓等疾病的遗传病因。

2. 康孕-染色体检测-100K (CNV-seq) 的有效数据量高达35M reads,相比低数据量而言,可带来更准确的检测结果,不仅可以减少假阳性带来的临床决策偏差,还可以有效降低假阴性导致的漏检发生,真正做到对临床负责,对受检者负责。

3. 中信湘雅生殖与遗传专科医院与深圳华大基因研究院合作建立了一种基于全基因组低覆盖度测序,从单细胞水平检测拷贝数变异(CNV)的信息分析方法(简称单细胞CNV方法),并将该技术回顾性分析了38个胚胎滋养层细胞。经过研究,科研人员发现该方法具有更高的特异性及灵敏性,未来可大力辅助生殖临床应用检测。

 

刚需产品调研及非刚需产品调研

刚需产品调研

中国主流基因测序公司的人类医学产品大类包括,辅助生殖、孕妇产前、新生儿检测、单基因病检测、肿瘤个体化治疗、遗传性肿瘤预测、肿瘤早期筛查等。

调研显示,辅助生殖、孕妇产前、肿瘤个体化治疗和肿瘤早期筛查产品的市场接受程度较高;而消费者为新生儿、单基因病、遗传性肿瘤预测等检测项目买单的意愿较低。(21世纪经济,2014)

产品线具体分析如下:

1、辅助生殖基因检测(刚需):

即通常所说的试管婴儿。但目前辅助生殖基因检测只能检测受精卵的染色体数目是否异常,可以筛查的疾病包括唐氏综合征等少量与染色体相关的疾病。准父母更加需要全基因组检测,以便事先获知其他疾病的发生几率,如癌症、心血管疾病等。

中华实用儿科临床杂志『2017,32(12)』报导:不明原因智力障碍64例全基因组拷贝数变异分析,64例智力障碍患儿中16例检出CNVs,检出率为25%。16例CNVs中,6例微缺失/微重复片段<5Mb,最小检出缺失片段0.53Mb,这在常规染色体核型分析中是无法检出的。

 

2、孕妇产前检测(刚需):

孕妇产前基因检测可代替羊水穿刺手段检测胎儿是否患有唐氏综合征等染色体疾病(T21T18T13),对于唐筛高危和高龄孕妇而言属于刚需产品。无创产前检测已成为基因公司医学部门的主要收入来源,市场前景广阔,竞争激烈。

以产前诊断为例,CNV技术具有通量高,成本低,实验操作简便,检测分辨率高,临床应用成熟稳定等特点,在一定程度上彻底改变了中国产前诊断供给不足的局面。使得中国产前诊断的核心痛点逐渐从“供给不足”转移到“遗传咨询能力不足”的问题上来了。http://www.seqchina.cn/10733.html  

 

3、肿瘤个体化治疗检测(准刚需):

在罹患肿瘤后,通过肿瘤相关基因检测可以使治疗、用药更加有针对性,并减少患者痛苦,以及延长生存期。但由于并不能保证治愈,所以这类检测归为准刚需产品。

目前推出的肿瘤个体化治疗基因检测既包括针对具体肿瘤的检测,又包括肿瘤相关全部基因检测,产品较为有效成熟。

患者进行此类检测,还可节省在身体上的试错性治疗,只需多花万元多的检测费用(全相关检测),故无论是患者还是患者家属均存在较大的意愿。

 

4、肿瘤早期筛查(准刚需):

由于近年来罹患肿瘤的比例逐渐增加,肿瘤早期筛查受到中等以上收入群体的青睐,在经济条件许可的条件下,大多数消费者愿意每年进行早期肿瘤筛查,以便治愈。事实上,即使低收入群体,也十分愿意在感觉不良时筛查是否罹患肿瘤。

调研对象给出的心理价位在3000-6000/年。但令人遗憾的是,除了虚假或夸大宣传外,目前没有基因公司可以提供精确度极高的早期肿瘤筛查检测,原因是样本人群尚未积累足够大,另外,对血液中游离的微量肿瘤DNA残片没有十分精确的检测方法。

 

 

非刚需产品调研

 

1、新生儿基因检测(非刚需):

新生儿基因检测的内容各公司存在差异,但大多包括常见的遗传性疾病,如地中海贫血、罕见病、新生儿耳聋等。但这些遗传性疾病中的大多数尚无成熟的治疗手段,仅有个别病种可提前干预,故新生儿基因检测属于非刚需产品。

接受采访的家长们称,知道孩子可能会罹患某种疾病,但也只是知道概率,并且现阶段医学难以治愈或预防,在经济条件允许的情况下可以检测;还有一部分受访者认为,只能提出问题,不能解决问题,还是不知道的好。

 

2、单基因病检测(非刚需):

单基因病,顾名思义是由单一基因引发的疾病,包括心脏系统、神经系统疾病等,如心源性猝死、肥厚型心肌病、帕金森综合症、阿尔茨海默病等。

由于单基因病检测是一种易发性疾病的预测,并且没有有效科学的预防手段,此类检测属于非刚需产品,虽然那些家族中存在猝死先例的个体有望尝试此类检测。

 

3、遗传性肿瘤预测检测(非刚需):

此类基因检测针对那些家族中有患病先例的个体,包括十余种有遗传性的肿瘤,如乳腺癌、卵巢癌、肺癌、肾癌、胃癌等。携带一些特定易感基因的个体比常人更容易罹患肿瘤。

但由于只能提出问题而不能解决问题,即在知道自己更易罹患某种疾病后,并无有效手段加以预防。一个例外的例子是乳腺癌,可以通过切除腺体预防疾病发生,但肺癌、胃癌、肾癌等的预防并不能靠切除的方法。故遗传性肿瘤预测检测属于非刚需产品,仍存在较大比例的中国公众宁愿不知道结果。

国际肿瘤学杂志(2012年8月第39卷第8期)综述报导:CNV如果发生在肿瘤相关基因序列内部或周围可能引起癌基因激活、抑癌基因失活,最终导致肿瘤的发生。CNV通过改变基因剂量、调节基因活性影响基因表达、表型差异和表型适应,从而引起肿瘤以及其他遗传疾病。研究CNV对于探索染色体重组、基因组进化、基因表达以及多种复杂疾病尤其是肿瘤的发病机制有很大帮助。  

 

在相关检测技术快速发展的推动下,人们已经发现了诸多与各类疾病发生密切相关的拷贝数变异。当前人们对拷贝数变异与疾病关系的认识主要集中于发育疾病、感染与免疫疾病、神经系统疾病以及各类肿瘤。

随着中国相关诊断供给能力的提升,大规模相关诊断临床实践经验和中国CNV大数据的积累必定会大大推动中国相关临床学科诊断依据和治疗方案能力的提升。  

 

基因组拷贝数目变异(CNV)目标客户

 

基因组拷贝数目变异(CNV)目标客户包括个人、医院、制药企业、政府研究机构、高校研究机构,也包括健康人群、高危人群,也可辅助治疗、预后监控。

 

基因组拷贝数目变异(CNV)可应用于临床和非临床方面,临床上,基因测序可用在生育健康检测、病原体感染检测和肿瘤基因检测。非临床上,可用于基础医学研究、新药研发、农牧业育种、生物多样性保护、司法鉴定、环境污染治理等。

 

2018年末,医院按等级分:三级医院1192(其中:三甲医院722),二级医院6780个,一级医院4989个,未评定等级医院6751个。目前全国几乎所有中大型医院都有对CNV检测的需求,这涉及所有的临床学科,绝大部分医院不能自行开展这些检测,必须委托第三方诊断公司。从有关报导来看,开展CNV的检测项目的,目前为止基本由贝瑞公司在做,但规模并不大。

 

健康管理和天赋基因的综合类检测,其针对目标为健康或亚健康人群,以较低廉的价格让消费者对自己的基因遗传情况以及患病可能有一定了解,这是市面上大众接触最多的一种类型。但这一类娱乐化较重,其专业性和医疗价值比较难以衡量,在专业性提升后潜力巨大。

 

了解家族历史、遗传疾病潜在风险,更好地规划生活、规范行为,这一需求促使着直接面向顾客(direct to consumer, DTC)类测序服务飞速发展,数以百万计的消费者成为生物技术公司的客户群,这背后的巨大市场也引入了企业和资本的涌入。

 

20190530日,世纪经济报道,直接面向顾客(DTC)是我国的主流模式,指在没有医疗人员参与的情况下,直接向消费者销售的体外诊断产品模式。消费级DTC基因检测产品的消费全流程一般包括五步:购买检测、绑定账号、唾液采样、回寄试管、查看报告。

 

2016年参与消费级基因检测并拥有自身数据的个人用户总量约为10万人,2017年约为30万人。目前,中国消费级基因检测服务的人口渗透率是0.03%,也就是说在2022年,中国将有5000万人拥有自己的基因组数据,市场空间巨大。

 

因此,开发基因组拷贝数目变异(CNV)临床检测应用具有互补性的项目,不仅可以填补国内的市场需求,而且,也是未来基因诊断行业的发展方向所在。

 

 

传统意义上的无创产前基因检测(NIPT

 

传统意义上的无创产前基因检测(NIPT),这在我国有很大的市场需求。仅2016年我国已完成了上百万例临床样本的检测。但根据国家卫计委在2014年已经批准开展的无创产前基因检测,主要针对的是包括唐氏综合征在内的三种染色体疾病而已,并非基因检测。像国内知名的华大基因,早在2014年推出了首个基于高通量测序技术针对夫妻双方在怀孕前或孕早期基因检测服务-康孕,这能够检测近600种单基因疾病,但价格并未公开。而在华大基因提供的其他孕期检测项目里,如“孕因宝”,这一通过唾液检测夫妻遗传病基因的服务,能够检测69种常见遗传病基因,价格为3500元。香港地区做这类产前遗传病基因测试,价格约为4,5008,000港元。

 

以一个比较成熟的市场产业链为例,《中国基因测序行业市场前瞻与投资战略规划报告》(数据来源参考)表明:随着二孩政策放开,高龄高危孕产妇比例明显增高,加上无创产前基因检测应用范围和检测范围的扩大,无创产前基因检测市场就有望在未来几年达到百亿元以上。

 

国内基因行业的龙头企业,布局了基因测序全产业链,包括上游的测序仪及试剂、中下游的基因测序服务提供,并在无创产检、PGS/PGD、肿瘤诊断及治疗、伴随诊断等方面有优势。  

 

3.拟开展的CNV和基因变异检测项目

神经系统疾病:

 

普拉德-威利_天使症候群(Parder-Willi Angelman syndrome)甲基化特异性多重连接探针扩增及甲基化特异性分析

脊髓性肌萎缩症及相关疾病SMA-SMN1SMN2基因剂量诊断分析

结节性硬化症的TSC基因拷贝数目分析

杜显氏/贝克氏肌肉萎缩症(DMD-BMD)基因拷贝数目分析

儿童自闭症、发育障碍、癫痫相关的大区域片段基因拷贝数目变异分析

中枢神经系统疾病发育不良,包括乔伯特综合症,先天性肌营养不良症,少年肌萎缩性侧索硬化,周期性麻痹,肌强直、桥小脑发育不全,大头小头畸形,脑白质营养不良, 遗传性痉挛性截瘫, 肌张力障碍和帕金森症等疾病基因分析

先天性低钾症评估

遗传性原发性运动感觉性神经病(Charcot-Marie-Tooth 夏科-马里-图思病)基因诊断

 

线粒体与代谢疾病:

 

线粒体基因大片段缺失分析

线粒体脑病/Leigh Syndrome核基因分析

进行性眼外肌麻痹(PEO/视神经萎缩核基因分析

新生儿代谢病

 

肿瘤:

 

乳腺癌BRCA1/BRCA2基因变异与大片段缺失与重复分析

结直肠癌和LYNCH综合征风险基因分析

遗传性胰腺癌基因变异分析

肿瘤相关50个基因的全面分析

肾癌相关基因分析

遗传性MDS/白血病基因突变与染色体易位分析

肿瘤单基因分析(TP53, PTEN, RET, PTCH1, STK11, VHL, FH, FLCN, PRKAR1A, MEN1, CDC73等等

儿童相关肿瘤基因分析

脑部肿瘤相关基因拷贝数目分析

甲状旁腺功能亢进/内分泌肿瘤基因分析

 

心血管疾病:

 

肥厚性与扩张型心肌病(HCM)基因分析

突发型心脏骤停性心律不齐

儿茶酚胺能性多动性室性心动过速

心律失常性右室心肌病

斯蒂克勒综合症

马凡综合征TAAD

家族性高胆固醇血症

Holt-Oram综合征(TBX5)

因子V莱顿血友病

QT综合征LQTS

 

 

其他罕见疾病:

 

性器官发育与性别反转基因检测

男性不育症AZT

遗传性多囊肾多囊肝

远端肾小管性酸中毒

肾结石症和肾钙化病

神经性耳聋STRC

免疫缺陷疾病包括自身免疫性淋巴组织增生综合征, IRAK4缺陷,重症联合免疫缺陷病( SCID )

骨骼发育不良

罗宾诺综合症

 

 

采用WGS和基因芯片技术对疾病相关的多种大区域CNV进行检测,覆盖数百种包括下列已知的病理性大片段CNV。同时对未知和新发现的千百种CNV进行检测和意义评估。

 

已知的病理性:

10q11.2 recurrent region (LCR-C to -D)

10q22.3q23.2 recurrent region (LCR-3/4-flanked) (includes BMPR1A)

11p11.2 (Potocki-Shaffer syndrome) region (includes ALX4, EXT2)

11p13 (WAGR syndrome) region

11q13.2q13.4 recurrent region (includes SHANK2, FGFs)

14q11.2 region (TCRA region)

14q11.2 region including CHD8 and SUPT16H

14q32 region associated with UPD(14) phenotypes

15q11.2 recurrent region (BP1-BP2) (includes NIPA1)

15q11q13 recurrent (PWS/AS) region (BP1-BP3, Class 1)

15q11q13 recurrent (PWS/AS) region (BP2-BP3, Class 2)

15q13.3 recurrent region (BP4-BP5) (includes CHRNA7)

15q13.3 recurrent region (D-CHRNA7 to BP5) (includes CHRNA7 and OTUD7A)

15q24 recurrent region (A-D) (includes SIN3A)

15q25.2 recurrent region (LCR B-C, proximal)

16p11.2 recurrent region (includes SH2B1) (distal region) (BP2-BP3)

16p11.2 recurrent region (includes TBX6) (proximal region) (BP4-BP5)

16p12.2 recurrent region (includes EEF2K, CDR2)

16p13.11 recurrent region (includes MYH11)

16p13.3 region (includes CREBBP)

17p11.2 recurrent (SMS/PLS) region (includes RAI1)

17p12 recurrent (HNPP/CMT1A) region (includes PMP22)

17p13.3 (Miller-Dieker syndrome) region (includes YWHAE and PAFAH1B1)

17q11.2 recurrent region (includes NF1)

17q12 recurrent (RCAD syndrome) region (includes HNF1B)

17q21.3 recurrent region (includes KANSL1)

19q13.3 region (PSG gene cluster)

1p36 terminal region (includes GABRD)

1q21.1 recurrent (TAR syndrome) region (BP2-BP3, proximal) (includes RBM8A)

1q21.1 recurrent region (BP3-BP4, distal) (includes GJA5)

1q21.2 region (polymorphic region)

1q43q44 terminal region (includes AKT3)

22q11.2 recurrent (DGS/VCFS) region (proximal, A-B) (includes TBX1)

22q11.2 recurrent (DGS/VCFS) region (proximal, A-D) (includes TBX1)

22q11.2 recurrent region (central, B/C-D) (includes CRKL)

22q11.2 recurrent region (distal type I, D-E/F)

22q11.2 recurrent region (distal type II, E-F)

22q11.21 recurrent (Cat eye syndrome) region (includes CECR2)

2p15p16.1 region (includes BCL11A)

2p21 region (includes PREPL and SLC3A1)

2p24.3 MYCN-DDX1 duplication region

2q11.2 recurrent region (ARID5A, LMAN2L included)

2q13 recurrent region (includes BCL2L11)

2q13 recurrent region (includes NPHP1)

2q21.1 recurrent region (includes ARHGEF4, GPR148)

2q37.3 terminal region (includes HDAC4)

3q29 recurrent region (includes DLG1)

4p16.3 terminal (Wolf-Hirshhorn syndrome) region

5p15 terminal (Cri du chat syndrome) region

5q35 recurrent (Sotos syndrome) region (includes NSD1)

6q24 region (includes PLAGL1)

7q11.23 recurrent (Williams-Beuren syndrome) region (includes ELN)

7q36.3 ZRS (SHH cis-regulatory) duplication region (within LMBR1 intron 5)

8p23.1 recurrent region (includes GATA4)

8p23.1 region (DEFB gene cluster)

DLK1-MEG3 Intergenic DMR

Xp11.22p11.23 recurrent region (includes SHROOM4)

Xp11.23 region (includes MAOA and MAOB)

Xp22.31 recurrent region (includes STS)

Xq28 recurrent region (includes GDI1)

Xq28 recurrent region (int22h1/int22h2-flanked) (includes RAB39B)

 

4.项目核心团队人员简历

 

谭端军 

医学博士 项目创始人 

毕业于中南大学湘雅医学院医疗系和解放军总医院军医进修学院;从事临床医学、遗传学与肿瘤研究十多年;先后在美国乔治城大学、纽约医学中心、美国三大基因检验公司中的QUEST和BIOREFERENCE从事人类疾病基因学研究和诊断工作近二十年;在美国BIOREFERENCE公司担任基因组拷贝数目变异(CNV)项目首席科学家及该项目研究团队负责人五年;率先开展了该CNV项目的全球(主要是殴美发达国家)最具学术前沿的诊断业务,学术成果发表在美国遗传学杂志等国际学术期刊上,拥有非常丰富的人类疾病基因学的知识和经验。

1979年  中南大学湘雅医学院医疗系

1990年  解放军总医院军医进修学院硕士

1995年  解放军总医院军医进修学院博士

2000年  美国乔治城大学博士后

2001年  解放军总医院副主任医师,副教授,硕士生导师

2002年  美国乔治城大学遗传与肿瘤研究所

2010年  美国纽约Downstate医学中心

2013年  美国Quest诊断公司

2014年-美国Bioreference基因诊断公司,CNV项目首席科学家及项目负责人

   

夏成  

公共健康硕士 项目创始人 

毕业于中南大学湘雅医学院医疗系和美国EMORY大学;先后从事国家卫生部、世界卫生组织(WHO)世界银行(WORLD BANK)美国疾病控制中心(CDC)大型健康项目研究和管理工作十多年;在国际大型金融集团的美国大都会保险公司(METLIFE)加拿大明信理财集团(CLARICA)和永明金融集团(SUN LIFE)工作二十多年;拥有丰富的健康项目管理基金、保险、税务、投资等专业工作经验。主要获奖:联合国开发计划署项目管理研究成果奖;美国大都会保险公司成就奖。

1979年  中南大学湘雅医学院医疗系

1985年  国家卫生部,疾病控制项目管理

1988年  世界卫生组织(WHO)亚太办事处(菲律宾马尼拉)项目管理

1991年  日本,巴西,菲律宾流行病学课题研究

1992年  世界银行疾病控制项目管理

1993年  美国Emory大学,公共卫生和健康管理(硕士)

1996年  美国疾病控制中心(CDC),热带病控制项目研究和管理

1997年-  分别在美国大都会(加拿大)保险公司,加拿大明信理财集团,加拿大永明理财集团工作,拥有基金、保险、投资的相关专业证书,熟悉北美企业、投资、财经和税务体系。  

 

周建国  

高级经济师 项目合伙人

毕业于湖南财经学院;1993年开始从事投资银行工作;先后任职于北京京华信托、大鹏证券、国元证券、湘财证券、中山证券、五矿证券等单位;全国首届经济师获得者,通过首届证券投行从业资格考试;主持山东浪潮、山东电缆、鲁银投资、正虹科技、银山化工等公司IPO上市业务;对企业上市、并购重组、财务顾问等业务具有丰富的实际操作经验。

数十年来,主要从事企业管理、企业投资融资、企业上市、投资基金等工作经验。

主导和指导了二十多家企业成功上市

1984  湖南大学财经学院

1993- 深圳证券公司投资银行部,投资基金  

 

 

 

5.深圳政府有关促进政策支持

 

《关于促进科技创新的若干措施》节选:

.鼓励海外高层次人才创新创业团队发起设立专业性、公益性、开放性的新型研发机构,予以最高1亿元支持。

.推动转制科研院所、高新技术企业、科技服务型企业实施管理层和核心骨干持股,持股比例上限放宽至30%

《关于促进人才优先发展的若干措施》节选

.经评审认定的海外高层次人才“团队+项目”,给予最高1亿元资助。

.出国留学人员来深创业,符合条件的给予30万元-100万元创业资助,特别优秀项目给予最高500万元资助。

.对符合条件的创客个人、创客团队项目给予最高100万元资助。

.支持境外机构在深圳设立具有独立法人资格、符合我市产业发展需求的技术转移机构,政府给予最高1000万元研发资助。

.2016-2020年期间,深圳将新筹集不少于30万套人才住房。

《深圳市鼓励总部企业发展暂行办法》节选

.经认定的总部企业,认定当年给予落户奖励1000万元。

.自认定年度第三年起可以提出申请贡献奖。奖励额为上一年度形成本市地方财力超过其自认定为总部企业年度以来历史最高值的30%,最高不超过2000万元。奖励资金应当用于在本市企业的技术研发、品牌推广、市场拓展和人力资源开发。

.在本市无自有办公用房的,自认定之日起3年内,租用总部自用办公用房(不包括附属设施和配套用房)的,每年按每平方米500元的标准给予补助,每年补助金额不超过150万元。

.在本市无自有办公用房的,自认定之日起3年内,购置总部自用办公用房(不包括附属设施和配套用房)的,按购房房价5%的标准给予一次性补助。

《深圳生物产业振兴发展政策》节选

.在深圳设立符合规定条件的研发中心、工程实验室、重点实验室、工程中心、公共技术服务平台,专项资金予以最高500万元资助。

.对自主创新生物产品研发,专项资金予以最高800万元资助。

.生物企业申请美国FDA认证、欧盟cGMPCE认证、世界卫生组织认证及其他国际市场准入认证,开展生物产品国际多中心临床研究或申请国外注册,专项资金予以最高800万元资助。

.经认定的生物企业入驻政府投资建设的创新型产业用房,首3年予以500平方米以下部分免房租、500-1000平方米部分房租减半资助。

.对属于产业发展重点领域且为产业链缺失环节的产业化项目,专项资金予以最高500万元资助。

.专项资金每年安排不低于500万元,用于资助在深圳举办中国国际医疗器械博览会等生物产业展会,深圳生物企业参加全国药品交易会、德国国际医院及医疗设备展览会(MEDICA)等境内外生物产业专业展会。

《深圳市未来产业发展政策》节选

(生命健康、海洋、航空航天等产业)

.在深圳设立符合规定条件的市级工程实验室、重点实验室、工程(技术)研究中心、企业技术中心,专项资金予以最高500万元支持。

.对开放式、专业化共性技术服务平台建设,专项资金予以最高500万元支持。

.企业申请并获得国内外市场准入认证的,专项资金予以最高500万元支持。

.专项资金每年安排不低于1000万元,用于支持深圳企业参加未来产业领域国内外知名展会,以及在深圳举办高水平的国际性展会。